Hugo_Symbol Chromosome Start_position End_position Variant_Classification Variant_Type Tumor_Sample_Barcode SampleSVCount pval subtype recurrent purity sv.support ID2 2 8749501 9175160 DEL SV 10-417-2263_pair 97 4.096910013 NA NA NA 0.068627451 ID2 2 8749501 9174781 DEL SV 10-417-2263_pair 97 4.096910013 NA NA NA 0.068627451 ID2 2 8749501 8959860 DEL SV DIPG01_TOR-pair 28 4.096910013 NA NA NA 0.464968153 ID2 2 8749501 16175698 h2hINV SV DIPG01_TOR-pair 28 4.096910013 NA NA NA 0.508333333 ID2 2 8749501 16397125 DUP SV DIPG01_TOR-pair 28 4.096910013 NA NA NA 5.782608696 ID2 2 8749501 8844220 DEL SV DIPG01_TOR-pair 28 4.096910013 NA NA NA 0.464968153 ID2 2 8749501 15626229 DEL SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.045325779 ID2 2 8749501 16230022 DEL SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.009302326 ID2 2 8749501 10307282 DUP SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.611111111 ID2 2 8749501 14581215 t2tINV SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.380952381 ID2 2 8749501 1161599 h2hINV SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.093220339 ID2 2 8749501 2973561 h2hINV SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.030456853 ID2 2 8749501 3011477 DEL SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.04815864 ID2 2 8749501 3126922 h2hINV SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.02173913 ID2 2 8749501 7527419 DEL SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.021428571 ID2 2 8749501 7527695 DEL SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.088757396 ID2 2 8749501 1153069 DUP SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 2.159292035 ID2 2 8749501 3075002 t2tINV SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.027777778 ID2 2 8749501 7571858 t2tINV SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.062176166 ID2 2 8749501 8717131 t2tINV SV DIPG104_EUR-pair 89 4.096910013 NA NA NA 0.120104439 ID2 2 8749501 16086525 DEL SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 1.363057325 ID2 2 8749501 8914317 h2hINV SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 0.029680365 ID2 2 8749501 8921733 DEL SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 0.082089552 ID2 2 8749501 15743871 DEL SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 1.936507937 ID2 2 8749501 16001352 h2hINV SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 4 ID2 2 8749501 16174538 DUP SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 3.789473684 ID2 2 8749501 8886322 t2tINV SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 0.014150943 ID2 2 8749501 16049701 DUP SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 14 ID2 2 8749501 9157910 DUP SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 0.923076923 ID2 2 8749501 203246643 INTER SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 0.831325301 ID2 2 8749501 204608940 INTER SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 10.6 ID2 2 8749501 8913672 h2hINV SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 0.029680365 ID2 2 8749501 8917254 DEL SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 0.082089552 ID2 2 8749501 8885787 t2tINV SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 0.014150943 ID2 2 8749501 8982642 DUP SV DIPG29_TOR-pair 52 4.096910013 NA NA NA 0.923076923 ID2 2 8749501 10581298 DUP SV GBM45-pair 57 4.096910013 NA NA NA 0.391304348 ID2 2 8749501 689092 INTER SV GBM60-pair 1413 4.096910013 NA NA NA 1.333333333 ID2 2 8749501 14287995 INTER SV GBM60-pair 1413 4.096910013 NA NA NA 1.444444444 ID2 2 8749501 9053004 t2tINV SV GBM60-pair 1413 4.096910013 NA NA NA 0.714285714 ID2 2 8749501 35595245 INTER SV GBM60-pair 1413 4.096910013 NA NA NA 1.088235294 ID2 2 8749501 8900786 t2tINV SV GBM60-pair 1413 4.096910013 NA NA NA 0.714285714 ID2 2 8749501 53365512 INTER SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.096910013 NA NA NA 0.346153846 ID2 2 8749501 75292969 INTER SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 4.096910013 NA NA NA 1.333333333 ID2 2 8749501 121435747 INTER SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 4.096910013 NA NA NA 1.137931034 ID2 2 8749501 39185385 DEL SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.020721925 ID2 2 8749501 16255253 DEL SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.06741573 ID2 2 8749501 8829497 DEL SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.0075 ID2 2 8749501 15934069 h2hINV SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.055837563 ID2 2 8749501 16123732 h2hINV SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.435643564 ID2 2 8749501 19887556 DUP SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.049079755 ID2 2 8749501 8820820 DUP SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.008542141 ID2 2 8749501 8821516 DUP SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.006028131 ID2 2 8749501 4680594 DEL SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.020588235 ID2 2 8749501 8601048 DEL SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.041916168 ID2 2 8749501 8828611 DEL SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.0075 ID2 2 8749501 8820042 DUP SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.008542141 ID2 2 8749501 8821025 DUP SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.006028131 ID2 2 8749501 243866925 INTER SV SJHGG052_A_STJ_WGS-pair 215 4.096910013 NA NA NA 0.165876777 FAM84A 2 14349501 130655262 INTER SV 10-417-1436_pair 148 3.958607315 NA NA NA 0.736842105 FAM84A 2 14349501 14557949 DUP SV 10-417-1436_pair 148 3.958607315 NA NA NA 0.282608696 FAM84A 2 14349501 130661835 INTER SV 10-417-1436_pair 148 3.958607315 NA NA NA 0.565217391 FAM84A 2 14349501 14496972 DUP SV 10-417-1436_pair 148 3.958607315 NA NA NA 0.282608696 FAM84A 2 14349501 14130324 h2hINV SV DIPG104_EUR-pair 89 3.958607315 NA NA NA 0.47826087 FAM84A 2 14349501 5374848 t2tINV SV DIPG104_EUR-pair 89 3.958607315 NA NA NA 0.7 FAM84A 2 14349501 9035289 t2tINV SV DIPG104_EUR-pair 89 3.958607315 NA NA NA 0.380952381 FAM84A 2 14349501 63788985 INTER SV DIPG60_TOR-pair 259 3.958607315 NA NA NA 2.076923077 FAM84A 2 14349501 38378068 INTER SV DIPG60_TOR-pair 259 3.958607315 NA NA NA 1.8 FAM84A 2 14349501 38361871 INTER SV DIPG60_TOR-pair 259 3.958607315 NA NA NA 1.863636364 FAM84A 2 14349501 38377917 INTER SV DIPG60_TOR-pair 259 3.958607315 NA NA NA 2.037037037 FAM84A 2 14349501 14341569 DUP SV DIPG60_TOR-pair 259 3.958607315 NA NA NA 2.380952381 FAM84A 2 14349501 14635315 DEL SV GBM45-pair 57 3.958607315 NA NA NA 0.411764706 FAM84A 2 14349501 52206086 INTER SV GBM45-pair 57 3.958607315 NA NA NA 1.8 FAM84A 2 14349501 14561434 DEL SV GBM45-pair 57 3.958607315 NA NA NA 0.411764706 KIT 4 54499501 58105184 DEL SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.184210526 KIT 4 54499501 58082190 DEL SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.121212121 KIT 4 54499501 55584149 DEL SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.101522843 KIT 4 54499501 55657768 DEL SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.059459459 KIT 4 54499501 55547996 DEL SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.048128342 KIT 4 54499501 63549758 h2hINV SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.726190476 KIT 4 54499501 56991007 DEL SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.075 KIT 4 54499501 143534965 DEL SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.038461538 KIT 4 54499501 57882410 t2tINV SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.380952381 KIT 4 54499501 58105513 DUP SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.244444444 KIT 4 54499501 55356452 DUP SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.090047393 KIT 4 54499501 62394132 t2tINV SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 1.2 KIT 4 54499501 63167353 t2tINV SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.150485437 KIT 4 54499501 55530031 DUP SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.058823529 KIT 4 54499501 55695529 DUP SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.043902439 KIT 4 54499501 55174826 DEL SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.101522843 KIT 4 54499501 55231156 DEL SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.059459459 KIT 4 54499501 55389241 DEL SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.048128342 KIT 4 54499501 54288009 DUP SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.562091503 KIT 4 54499501 55044431 DUP SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.090047393 KIT 4 54499501 55136255 DUP SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.058823529 KIT 4 54499501 55647500 DUP SV 00-004Recurrent 422 4.638272164 NA NA NA 0.043902439 KIT 4 54499501 55163488 DUP SV 00-026Primary 30 4.638272164 NA NA NA 0.43902439 KIT 4 54499501 55077843 DUP SV 00-026Primary 30 4.638272164 NA NA NA 0.43902439 KIT 4 54499501 55697262 h2hINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.054329372 KIT 4 54499501 55953837 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.076677316 KIT 4 54499501 54894903 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.02173913 KIT 4 54499501 56005858 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.032307692 KIT 4 54499501 55550396 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.034883721 KIT 4 54499501 55133556 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.223608445 KIT 4 54499501 55023463 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.012093726 KIT 4 54499501 55090354 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.006364922 KIT 4 54499501 55090365 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.00911641 KIT 4 54499501 55169888 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.003891051 KIT 4 54499501 55686176 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.010802469 KIT 4 54499501 55276043 h2hINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.007423905 KIT 4 54499501 55191956 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.001840773 KIT 4 54499501 55421910 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.004933051 KIT 4 54499501 55260702 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.021887334 KIT 4 54499501 55277218 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.001904037 KIT 4 54499501 55647722 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.005434783 KIT 4 54499501 55728249 h2hINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.008379888 KIT 4 54499501 55384349 h2hINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.007270324 KIT 4 54499501 55541086 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.00685401 KIT 4 54499501 56021043 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.01174743 KIT 4 54499501 56002617 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.015128593 KIT 4 54499501 55906432 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.003418803 KIT 4 54499501 54984639 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.007062147 KIT 4 54499501 55649365 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.064748201 KIT 4 54499501 54603267 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.037914692 KIT 4 54499501 56034880 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.332635983 KIT 4 54499501 54953144 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.035063114 KIT 4 54499501 55648887 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.04610951 KIT 4 54499501 55602332 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.01062417 KIT 4 54499501 55544850 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.215533981 KIT 4 54499501 55520702 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.002888087 KIT 4 54499501 55415704 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.002754821 KIT 4 54499501 55771348 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.060294118 KIT 4 54499501 55394062 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.001448226 KIT 4 54499501 55651483 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.007896626 KIT 4 54499501 55934765 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.022187005 KIT 4 54499501 54244142 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.033499644 KIT 4 54499501 54247197 h2hINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.032310178 KIT 4 54499501 54247318 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.159663866 KIT 4 54499501 54300787 h2hINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.138461538 KIT 4 54499501 54767529 h2hINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.054329372 KIT 4 54499501 54828766 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.076677316 KIT 4 54499501 54891202 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.02173913 KIT 4 54499501 54917749 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.034883721 KIT 4 54499501 54960304 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.223608445 KIT 4 54499501 55023065 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.012093726 KIT 4 54499501 55090095 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.006364922 KIT 4 54499501 55090095 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.00911641 KIT 4 54499501 55110250 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.003891051 KIT 4 54499501 55126889 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.010802469 KIT 4 54499501 55171023 h2hINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.007423905 KIT 4 54499501 55191860 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.001840773 KIT 4 54499501 55241420 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.004933051 KIT 4 54499501 55255934 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.021887334 KIT 4 54499501 55276929 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.001904037 KIT 4 54499501 55296490 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.005434783 KIT 4 54499501 55304984 h2hINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.008379888 KIT 4 54499501 55350318 h2hINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.007270324 KIT 4 54499501 55383427 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.00685401 KIT 4 54499501 55906153 DEL SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.003418803 KIT 4 54499501 7912811 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.023048327 KIT 4 54499501 39368548 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.059701493 KIT 4 54499501 54243712 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.039259259 KIT 4 54499501 54246571 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.090782123 KIT 4 54499501 54296802 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.049780381 KIT 4 54499501 54332260 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.434782609 KIT 4 54499501 54502316 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.007062147 KIT 4 54499501 54585058 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.064748201 KIT 4 54499501 54592250 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.037914692 KIT 4 54499501 54830226 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.035063114 KIT 4 54499501 54934365 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.04610951 KIT 4 54499501 54946818 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.01062417 KIT 4 54499501 54954665 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.215533981 KIT 4 54499501 55144754 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.002888087 KIT 4 54499501 55243205 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.002754821 KIT 4 54499501 55254744 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.060294118 KIT 4 54499501 55385300 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.001448226 KIT 4 54499501 55648969 t2tINV SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.007896626 KIT 4 54499501 55663355 DUP SV 00-032Primary 104 4.638272164 NA NA NA 0.022187005 KIT 4 54499501 56034880 DUP SV 00-033Primary 64 4.638272164 NA NA NA 0.142857143 KIT 4 54499501 55766299 h2hINV SV 00-041Primary 32 4.638272164 NA NA NA 0.101265823 KIT 4 54499501 55764637 h2hINV SV 00-041Primary 32 4.638272164 NA NA NA 0.101265823 KIT 4 54499501 55833736 DEL SV DIPG06_TOR-pair 118 4.638272164 NA NA NA 1.076923077 KIT 4 54499501 56213581 h2hINV SV DIPG06_TOR-pair 118 4.638272164 NA NA NA 1.76 KIT 4 54499501 54732248 t2tINV SV DIPG06_TOR-pair 118 4.638272164 NA NA NA 0.035971223 KIT 4 54499501 55354579 t2tINV SV DIPG06_TOR-pair 118 4.638272164 NA NA NA 0.073170732 KIT 4 54499501 56381694 DUP SV DIPG06_TOR-pair 118 4.638272164 NA NA NA 1.472727273 KIT 4 54499501 55621684 DEL SV DIPG06_TOR-pair 118 4.638272164 NA NA NA 1.076923077 KIT 4 54499501 54731252 t2tINV SV DIPG06_TOR-pair 118 4.638272164 NA NA NA 0.035971223 KIT 4 54499501 55353499 t2tINV SV DIPG06_TOR-pair 118 4.638272164 NA NA NA 0.073170732 KIT 4 54499501 9831640 h2hINV SV DIPG07_TOR-pair 89 4.638272164 NA NA NA 0.176470588 KIT 4 54499501 5047464 INTER SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.260162602 KIT 4 54499501 58108969 DEL SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.438356164 KIT 4 54499501 55137100 DEL SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.117647059 KIT 4 54499501 55136883 DEL SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.090909091 KIT 4 54499501 5185723 INTER SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.291139241 KIT 4 54499501 4783768 INTER SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.277227723 KIT 4 54499501 54856197 DUP SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.06993007 KIT 4 54499501 4848989 INTER SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.1953125 KIT 4 54499501 4883951 INTER SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.192592593 KIT 4 54499501 7685395 h2hINV SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.243421053 KIT 4 54499501 54343938 DEL SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.26446281 KIT 4 54499501 54438227 DEL SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.21875 KIT 4 54499501 55120409 DEL SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.117647059 KIT 4 54499501 55125587 DEL SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.090909091 KIT 4 54499501 7701736 t2tINV SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.267857143 KIT 4 54499501 54279532 t2tINV SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.260273973 KIT 4 54499501 54388097 t2tINV SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.275510204 KIT 4 54499501 54411824 t2tINV SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.245901639 KIT 4 54499501 54538405 DUP SV DIPG19_TOR-pair 26 4.638272164 NA NA NA 0.06993007 KIT 4 54499501 3412484 DUP SV DIPG28_TOR-pair 27 4.638272164 NA NA NA 6.574468085 KIT 4 54499501 55135885 h2hINV SV DIPG57_TOR-pair 135 4.638272164 NA NA NA 2.082568807 KIT 4 54499501 55521146 h2hINV SV DIPG57_TOR-pair 135 4.638272164 NA NA NA 4.6 KIT 4 54499501 108737830 INTER SV DIPG57_TOR-pair 135 4.638272164 NA NA NA 1.157894737 KIT 4 54499501 56508838 DUP SV DIPG57_TOR-pair 135 4.638272164 NA NA NA 3.953488372 KIT 4 54499501 56473879 t2tINV SV DIPG57_TOR-pair 135 4.638272164 NA NA NA 5.175438596 KIT 4 54499501 108737815 INTER SV DIPG57_TOR-pair 135 4.638272164 NA NA NA 0.705882353 KIT 4 54499501 35569517 h2hINV SV DIPG57_TOR-pair 135 4.638272164 NA NA NA 0.327586207 KIT 4 54499501 54648223 h2hINV SV DIPG57_TOR-pair 135 4.638272164 NA NA NA 2.082568807 KIT 4 54499501 55409096 h2hINV SV DIPG57_TOR-pair 135 4.638272164 NA NA NA 4.6 KIT 4 54499501 26713748 DUP SV DIPG57_TOR-pair 135 4.638272164 NA NA NA 0.246376812 KIT 4 54499501 54468978 t2tINV SV DIPG57_TOR-pair 135 4.638272164 NA NA NA 4.050847458 KIT 4 54499501 53026779 DUP SV DIPG60_TOR-pair 259 4.638272164 NA NA NA 0.375 KIT 4 54499501 56181154 DEL SV DIPG61_TOR-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.028089888 KIT 4 54499501 55139005 DEL SV DIPG61_TOR-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.023489933 KIT 4 54499501 74996295 INTER SV DIPG61_TOR-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.611111111 KIT 4 54499501 55841391 DEL SV DIPG61_TOR-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.292035398 KIT 4 54499501 60009929 INTER SV DIPG61_TOR-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.277777778 KIT 4 54499501 55134024 DEL SV DIPG61_TOR-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.023489933 KIT 4 54499501 55241427 DEL SV DIPG61_TOR-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.292035398 KIT 4 54499501 56429774 DEL SV GBM17-pair 161 4.638272164 NA NA NA 0.354545455 KIT 4 54499501 56431084 h2hINV SV GBM17-pair 161 4.638272164 NA NA NA 0.281818182 KIT 4 54499501 55982546 t2tINV SV GBM17-pair 161 4.638272164 NA NA NA 0.227848101 KIT 4 54499501 16936513 h2hINV SV GBM17-pair 161 4.638272164 NA NA NA 0.378378378 KIT 4 54499501 55976591 t2tINV SV GBM17-pair 161 4.638272164 NA NA NA 0.227848101 KIT 4 54499501 11818767 INTER SV GBM17-pair 161 4.638272164 NA NA NA 0.483516484 KIT 4 54499501 235330581 INTER SV GBM26-pair 610 4.638272164 NA NA NA 1.105263158 KIT 4 54499501 57187182 DUP SV GBM45-pair 57 4.638272164 NA NA NA 0.21875 KIT 4 54499501 54919671 h2hINV SV GBM60-pair 1413 4.638272164 NA NA NA 0.211267606 KIT 4 54499501 61632179 INTER SV GBM60-pair 1413 4.638272164 NA NA NA 0.777777778 KIT 4 54499501 23538540 INTER SV GBM60-pair 1413 4.638272164 NA NA NA 0.961538462 KIT 4 54499501 39591532 INTER SV GBM60-pair 1413 4.638272164 NA NA NA 0.615384615 KIT 4 54499501 54919461 h2hINV SV GBM60-pair 1413 4.638272164 NA NA NA 0.211267606 KIT 4 54499501 54711866 h2hINV SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 0.174698795 KIT 4 54499501 43675144 INTER SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 2.357142857 KIT 4 54499501 99866633 h2hINV SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 7.642857143 KIT 4 54499501 54710568 DUP SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 0.163157895 KIT 4 54499501 54711581 t2tINV SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 0.121546961 KIT 4 54499501 54710656 DUP SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 0.195 KIT 4 54499501 15127418 INTER SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 0.403225806 KIT 4 54499501 54710677 h2hINV SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 0.174698795 KIT 4 54499501 54709845 DUP SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 0.163157895 KIT 4 54499501 54709934 t2tINV SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 0.121546961 KIT 4 54499501 54710134 DUP SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 0.195 KIT 4 54499501 209898056 INTER SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 4.638272164 NA NA NA 1.230769231 KIT 4 54499501 54855665 DUP SV SJHGG015_D_STJ_WGS-pair 5 4.638272164 NA NA NA 1.606060606 KIT 4 54499501 54707399 DUP SV SJHGG015_D_STJ_WGS-pair 5 4.638272164 NA NA NA 1.606060606 KIT 4 54499501 99221409 INTER SV SJHGG022_D_STJ_WGS-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.236842105 KIT 4 54499501 98358659 INTER SV SJHGG022_D_STJ_WGS-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.45 KIT 4 54499501 99198771 INTER SV SJHGG022_D_STJ_WGS-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.4375 KIT 4 54499501 99200204 INTER SV SJHGG022_D_STJ_WGS-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.333333333 KIT 4 54499501 99662645 INTER SV SJHGG022_D_STJ_WGS-pair 49 4.638272164 NA NA NA 0.225806452 KIT 4 54499501 54686538 h2hINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.00811359 KIT 4 54499501 54999263 DEL SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.123552124 KIT 4 54499501 55047260 h2hINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.00907441 KIT 4 54499501 55059931 h2hINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.015695067 KIT 4 54499501 55230901 h2hINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.010080645 KIT 4 54499501 55665701 h2hINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.026143791 KIT 4 54499501 86550402 DEL SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 3.828947368 KIT 4 54499501 86544260 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 3.164179104 KIT 4 54499501 54971499 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.058201058 KIT 4 54499501 54771134 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.030716724 KIT 4 54499501 54825120 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.024144869 KIT 4 54499501 55058410 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.152263374 KIT 4 54499501 55012416 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.069078947 KIT 4 54499501 55067250 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.052478134 KIT 4 54499501 55077275 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.031468531 KIT 4 54499501 55293926 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.017021277 KIT 4 54499501 55477343 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.021352313 KIT 4 54499501 55485886 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.028776978 KIT 4 54499501 55602079 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.033126294 KIT 4 54499501 55611872 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.038596491 KIT 4 54499501 55929719 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.010121457 KIT 4 54499501 55937876 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.02698145 KIT 4 54499501 114496418 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.44011976 KIT 4 54499501 23725964 INTER SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.476190476 KIT 4 54499501 54685185 h2hINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.00811359 KIT 4 54499501 54948096 DEL SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.123552124 KIT 4 54499501 55046476 h2hINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.00907441 KIT 4 54499501 55058941 h2hINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.015695067 KIT 4 54499501 55228942 h2hINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.010080645 KIT 4 54499501 55664923 h2hINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.026143791 KIT 4 54499501 54767595 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.058201058 KIT 4 54499501 54770384 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.030716724 KIT 4 54499501 54823858 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.024144869 KIT 4 54499501 54916395 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.152263374 KIT 4 54499501 54971383 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.069078947 KIT 4 54499501 55066751 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.052478134 KIT 4 54499501 55076548 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.031468531 KIT 4 54499501 55292332 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.017021277 KIT 4 54499501 55476186 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.021352313 KIT 4 54499501 55485347 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.028776978 KIT 4 54499501 55601555 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.033126294 KIT 4 54499501 55611179 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.038596491 KIT 4 54499501 55928838 t2tINV SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.010121457 KIT 4 54499501 55937387 DUP SV SJHGG075_A_STJ_WGS-pair 106 4.638272164 NA NA NA 0.02698145 SLC6A19 5 999501 1289947 DUP SV 00-001Recurrent 220 3.958607315 NA NA NA 0.129032258 SLC6A19 5 999501 1289432 DUP SV 00-001Recurrent 220 3.958607315 NA NA NA 0.129032258 SLC6A19 5 999501 1273880 DEL SV 00-010Primary 31 3.958607315 NA NA NA 0.166666667 SLC6A19 5 999501 1272728 DEL SV 00-010Primary 31 3.958607315 NA NA NA 0.166666667 SLC6A19 5 999501 1641605 DUP SV 00-018Primary 215 3.958607315 NA NA NA 0.315789474 SLC6A19 5 999501 1238798 DUP SV 00-053Primary 154 3.958607315 NA NA NA 0.09375 SLC6A19 5 999501 1238358 DUP SV 00-053Primary 154 3.958607315 NA NA NA 0.09375 SLC6A19 5 999501 1394051 DEL SV 10-417-2218_pair 305 3.958607315 NA NA NA 0.070588235 SLC6A19 5 999501 1393752 DEL SV 10-417-2218_pair 305 3.958607315 NA NA NA 0.070588235 SLC6A19 5 999501 14413619 h2hINV SV GBM23-pair 190 3.958607315 NA NA NA 2 SLC6A19 5 999501 1197213 DEL SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.037988827 SLC6A19 5 999501 1190391 DEL SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.008413462 SLC6A19 5 999501 1232115 DEL SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.031007752 SLC6A19 5 999501 42850741 DEL SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.163120567 SLC6A19 5 999501 42801828 DEL SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.083333333 SLC6A19 5 999501 112943727 INTER SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.125760649 SLC6A19 5 999501 6773982 INTER SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.024358974 SLC6A19 5 999501 49844538 INTER SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.819548872 SLC6A19 5 999501 24761615 INTER SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.119127517 SLC6A19 5 999501 1344658 t2tINV SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.011160714 SLC6A19 5 999501 49832915 INTER SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 1.223350254 SLC6A19 5 999501 30778253 INTER SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.036619718 SLC6A19 5 999501 1276454 DUP SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.014043584 SLC6A19 5 999501 1161547 DEL SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.037988827 SLC6A19 5 999501 1189085 DEL SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.008413462 SLC6A19 5 999501 1196438 DEL SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.031007752 SLC6A19 5 999501 1162840 t2tINV SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.011160714 SLC6A19 5 999501 1275899 DUP SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 0.014043584 SLC6A19 5 999501 106129938 INTER SV GBM38-pair 191 3.958607315 NA NA NA 1.165876777 SLC6A19 5 999501 16315976 h2hINV SV GBM46-pair 96 3.958607315 NA NA NA 2.071428571 SLC6A19 5 999501 1671846 h2hINV SV GBM46-pair 96 3.958607315 NA NA NA 1.357142857 SLC6A19 5 999501 17021878 t2tINV SV GBM46-pair 96 3.958607315 NA NA NA 0.611111111 SLC6A19 5 999501 16315975 t2tINV SV GBM46-pair 96 3.958607315 NA NA NA 1.714285714 SLC6A19 5 999501 33708395 INTER SV GBM59-pair 152 3.958607315 NA NA NA 2.260869565 SLC6A19 5 999501 1251957 DEL SV GBM59-pair 152 3.958607315 NA NA NA 2.962025316 SLC6A19 5 999501 7869438 h2hINV SV GBM59-pair 152 3.958607315 NA NA NA 8.620689655 SLC6A19 5 999501 29155647 DUP SV GBM59-pair 152 3.958607315 NA NA NA Inf SLC6A19 5 999501 141476 INTER SV GBM59-pair 152 3.958607315 NA NA NA 0.148148148 SLC6A19 5 999501 1250450 DEL SV GBM59-pair 152 3.958607315 NA NA NA 2.962025316 SLC6A19 5 999501 82481105 INTER SV SJHGG033_D_STJ_WGS-pair 104 3.958607315 NA NA NA 0.628571429 SLC6A19 5 999501 1819920 DEL SV SJHGG033_D_STJ_WGS-pair 104 3.958607315 NA NA NA 1 SLC6A19 5 999501 31521055 h2hINV SV SJHGG033_D_STJ_WGS-pair 104 3.958607315 NA NA NA 0.633333333 SLC6A19 5 999501 31416798 t2tINV SV SJHGG033_D_STJ_WGS-pair 104 3.958607315 NA NA NA 1.25 SLC6A19 5 999501 27724862 t2tINV SV SJHGG033_D_STJ_WGS-pair 104 3.958607315 NA NA NA 1.1 SLC6A19 5 999501 1727785 DUP SV SJHGG033_D_STJ_WGS-pair 104 3.958607315 NA NA NA 1 11-Mar 5 15699501 12110626 t2tINV SV GBM11-pair 60 3.585026652 NA NA NA 1.454545455 11-Mar 5 15699501 24065041 DEL SV GBM23-pair 190 3.585026652 NA NA NA 1.6 11-Mar 5 15699501 19105822 t2tINV SV GBM23-pair 190 3.585026652 NA NA NA 1.545454545 11-Mar 5 15699501 6335802 DUP SV GBM23-pair 190 3.585026652 NA NA NA 1.25 11-Mar 5 15699501 7653411 t2tINV SV GBM23-pair 190 3.585026652 NA NA NA 1.785714286 11-Mar 5 15699501 3489328 h2hINV SV GBM38-pair 191 3.585026652 NA NA NA 0.533333333 11-Mar 5 15699501 6441508 DEL SV GBM38-pair 191 3.585026652 NA NA NA 0.40625 11-Mar 5 15699501 6762837 DUP SV GBM38-pair 191 3.585026652 NA NA NA 0.407407407 11-Mar 5 15699501 17490524 INTER SV GBM60-pair 1413 3.585026652 NA NA NA 0.722222222 11-Mar 5 15699501 114901827 INTER SV GBM60-pair 1413 3.585026652 NA NA NA 0.9 11-Mar 5 15699501 118295401 INTER SV GBM60-pair 1413 3.585026652 NA NA NA 1.636363636 TWISTNB 7 19249501 30657814 DUP SV GBM19-pair 20 3.619788758 NA NA NA 0.6 TWISTNB 7 19249501 52236680 h2hINV SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 3.482758621 TWISTNB 7 19249501 19559816 DEL SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 0.268292683 TWISTNB 7 19249501 52266919 h2hINV SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 0.5 TWISTNB 7 19249501 52267226 h2hINV SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 0.5625 TWISTNB 7 19249501 56259530 h2hINV SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 1 TWISTNB 7 19249501 52267711 DEL SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 0.588235294 TWISTNB 7 19249501 19346868 DUP SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 0.548672566 TWISTNB 7 19249501 56259383 DUP SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 0.322580645 TWISTNB 7 19249501 56258882 t2tINV SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 5.32 TWISTNB 7 19249501 11907063 DEL SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 2.486486486 TWISTNB 7 19249501 12047467 DEL SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 0.120689655 TWISTNB 7 19249501 15144520 h2hINV SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 0.25862069 TWISTNB 7 19249501 19557787 DEL SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 0.268292683 TWISTNB 7 19249501 19036730 DUP SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 0.444444444 TWISTNB 7 19249501 19346736 DUP SV GBM48-pair 177 3.619788758 NA NA NA 0.548672566 TWISTNB 7 19249501 33785361 h2hINV SV GBM53-pair 128 3.619788758 NA NA NA 0.574468085 TWISTNB 7 19249501 55312405 DEL SV GBM53-pair 128 3.619788758 NA NA NA 0.41025641 TWISTNB 7 19249501 52716580 t2tINV SV GBM53-pair 128 3.619788758 NA NA NA 0.666666667 TWISTNB 7 19249501 54767081 DUP SV GBM53-pair 128 3.619788758 NA NA NA 0.351351351 TWISTNB 7 19249501 62196589 INTER SV GBM60-pair 1413 3.619788758 NA NA NA 0.769230769 TWISTNB 7 19249501 19712830 t2tINV SV GBM60-pair 1413 3.619788758 NA NA NA 1 TWISTNB 7 19249501 17990071 DUP SV GBM60-pair 1413 3.619788758 NA NA NA 1.222222222 TWISTNB 7 19249501 169025353 INTER SV GBM60-pair 1413 3.619788758 NA NA NA 0.777777778 TWISTNB 7 19249501 55727912 DEL SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 0.242424242 TWISTNB 7 19249501 99872478 INTER SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 3.277777778 TWISTNB 7 19249501 55295857 h2hINV SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 0.076446281 TWISTNB 7 19249501 56554201 t2tINV SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 1.166666667 TWISTNB 7 19249501 38594232 t2tINV SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 0.620689655 TWISTNB 7 19249501 19476238 t2tINV SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 0.619469027 TWISTNB 7 19249501 99149564 INTER SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 4.419354839 TWISTNB 7 19249501 19718577 DUP SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 0.594202899 TWISTNB 7 19249501 54893300 t2tINV SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 0.06 TWISTNB 7 19249501 46662037 INTER SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 1.8125 TWISTNB 7 19249501 12639914 DUP SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 0.947368421 TWISTNB 7 19249501 19472240 t2tINV SV GBM65-pair 200 3.619788758 NA NA NA 0.619469027 TWISTNB 7 19249501 21140333 h2hINV SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 3.619788758 NA NA NA 0.933333333 TWISTNB 7 19249501 68759525 INTER SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 3.619788758 NA NA NA 0.238095238 MET 7 116099501 116537828 DUP SV 00-001Recurrent 220 5.107905397 NA NA NA 0.184210526 MET 7 116099501 115724341 DEL SV 00-001Recurrent 220 5.107905397 NA NA NA 0.217391304 MET 7 116099501 106130341 DUP SV 00-001Recurrent 220 5.107905397 NA NA NA 0.368421053 MET 7 116099501 116324940 DUP SV 00-001Recurrent 220 5.107905397 NA NA NA 0.184210526 MET 7 116099501 123299726 h2hINV SV 00-019Primary 1166 5.107905397 NA NA NA 0.236842105 MET 7 116099501 87345226 INTER SV 00-019Primary 1166 5.107905397 NA NA NA 0.307692308 MET 7 116099501 115778982 t2tINV SV 00-019Primary 1166 5.107905397 NA NA NA 0.157894737 MET 7 116099501 116420929 DEL SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.621428571 MET 7 116099501 116424881 DEL SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.610738255 MET 7 116099501 116577147 DEL SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.605263158 MET 7 116099501 116519512 DUP SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.74025974 MET 7 116099501 116418494 DUP SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.232597623 MET 7 116099501 75519038 INTER SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.958333333 MET 7 116099501 75519038 INTER SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 1.75 MET 7 116099501 116392979 DEL SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.621428571 MET 7 116099501 116422445 DEL SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.610738255 MET 7 116099501 116523828 DEL SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.605263158 MET 7 116099501 116317481 DUP SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.74025974 MET 7 116099501 116413568 DUP SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.232597623 MET 7 116099501 134118030 INTER SV 00-049Primary 67 5.107905397 NA NA NA 0.029972752 MET 7 116099501 69651188 INTER SV 10-417-6070_pair 87 5.107905397 NA NA NA 1.060606061 MET 7 116099501 69651179 INTER SV 10-417-6070_pair 87 5.107905397 NA NA NA 1.925 MET 7 116099501 121253361 DEL SV DIPG61_TOR-pair 49 5.107905397 NA NA NA 0.730769231 MET 7 116099501 139795074 DEL SV DIPG81_EUR-pair 69 5.107905397 NA NA NA 0.851851852 MET 7 116099501 116707454 DUP SV DIPG81_EUR-pair 69 5.107905397 NA NA NA 1.6875 MET 7 116099501 100452347 INTER SV GBM1-pair 131 5.107905397 NA NA NA 1.133333333 MET 7 116099501 100452358 INTER SV GBM1-pair 131 5.107905397 NA NA NA 1.894736842 MET 7 116099501 131545398 h2hINV SV GBM11-pair 60 5.107905397 NA NA NA 1.7 MET 7 116099501 121553183 DUP SV GBM11-pair 60 5.107905397 NA NA NA 0.848484848 MET 7 116099501 116726189 DUP SV GBM43-pair 49 5.107905397 NA NA NA 3.507246377 MET 7 116099501 116390797 DUP SV GBM43-pair 49 5.107905397 NA NA NA 0.441358025 MET 7 116099501 116376397 DUP SV GBM43-pair 49 5.107905397 NA NA NA 0.441358025 MET 7 116099501 91763043 INTER SV GBM60-pair 1413 5.107905397 NA NA NA 0.379310345 MET 7 116099501 104277872 t2tINV SV GBM60-pair 1413 5.107905397 NA NA NA 0.29787234 MET 7 116099501 175688100 INTER SV GBM60-pair 1413 5.107905397 NA NA NA 1.55 MET 7 116099501 113473561 DEL SV SJHGG006_A_STJ_WGS-pair 44 5.107905397 NA NA NA 2.0625 MET 7 116099501 71633091 INTER SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 5.107905397 NA NA NA 0.45 MET 7 116099501 199749 DEL SV SJHGG011_D_STJ_WGS-pair 606 5.107905397 NA NA NA 0.952380952 MET 7 116099501 116725955 DUP SV SJHGG024_D_STJ_WGS-pair 36 5.107905397 NA NA NA 0.345454545 MET 7 116099501 126223552 INTER SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 1.768115942 MET 7 116099501 120190244 t2tINV SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 5.803030303 MET 7 116099501 116273672 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.040506329 MET 7 116099501 116298088 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.033126294 MET 7 116099501 116328960 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.053398058 MET 7 116099501 116338543 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.052757794 MET 7 116099501 116339205 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.044554455 MET 7 116099501 116381566 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.040302267 MET 7 116099501 116388901 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.036036036 MET 7 116099501 116411604 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.067873303 MET 7 116099501 116416829 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.058823529 MET 7 116099501 116419680 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.039408867 MET 7 116099501 116446623 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.058956916 MET 7 116099501 116454090 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.05952381 MET 7 116099501 116273001 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.040506329 MET 7 116099501 116297558 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.033126294 MET 7 116099501 116328297 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.053398058 MET 7 116099501 116337888 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.052757794 MET 7 116099501 116338686 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.044554455 MET 7 116099501 116380864 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.040302267 MET 7 116099501 116388346 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.036036036 MET 7 116099501 116410883 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.067873303 MET 7 116099501 116416305 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.058823529 MET 7 116099501 116419126 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.039408867 MET 7 116099501 116445904 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.058956916 MET 7 116099501 116453336 DUP SV SJHGG044_D_STJ_WGS-pair 371 5.107905397 NA NA NA 0.05952381 GSDMC 8 130349501 130692903 DUP SV 00-010Primary 31 8.200659451 NA NA NA 0.697674419 GSDMC 8 130349501 130554927 DUP SV 00-010Primary 31 8.200659451 NA NA NA 0.697674419 GSDMC 8 130349501 130345654 DUP SV 00-025Primary 20 8.200659451 NA NA NA 0.695652174 GSDMC 8 130349501 130684075 DUP SV 00-026Primary 30 8.200659451 NA NA NA 0.421052632 GSDMC 8 130349501 130508460 DUP SV 00-026Primary 30 8.200659451 NA NA NA 0.421052632 GSDMC 8 130349501 130767586 DUP SV 00-036Primary 48 8.200659451 NA NA NA 0.782608696 GSDMC 8 130349501 130479279 DUP SV 00-036Primary 48 8.200659451 NA NA NA 0.782608696 GSDMC 8 130349501 130788697 DUP SV 00-039Primary 37 8.200659451 NA NA NA 0.425 GSDMC 8 130349501 130363277 DUP SV 00-039Primary 37 8.200659451 NA NA NA 0.425 GSDMC 8 130349501 130710504 DUP SV 00-040Primary 44 8.200659451 NA NA NA 0.711111111 GSDMC 8 130349501 130468595 DUP SV 00-040Primary 44 8.200659451 NA NA NA 0.711111111 GSDMC 8 130349501 130737791 DUP SV 00-053Primary 154 8.200659451 NA NA NA 0.784313725 GSDMC 8 130349501 130520790 DUP SV 00-053Primary 154 8.200659451 NA NA NA 0.784313725 GSDMC 8 130349501 39651230 INTER SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.063218391 GSDMC 8 130349501 130677988 h2hINV SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.377272727 GSDMC 8 130349501 130837891 t2tINV SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.44047619 GSDMC 8 130349501 39678436 INTER SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.058139535 GSDMC 8 130349501 130710600 DUP SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.02688172 GSDMC 8 130349501 130817341 t2tINV SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.026109661 GSDMC 8 130349501 130884722 DUP SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.033742331 GSDMC 8 130349501 128665700 DEL SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.048192771 GSDMC 8 130349501 128877973 h2hINV SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.078014184 GSDMC 8 130349501 129165231 h2hINV SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.074829932 GSDMC 8 130349501 129887959 h2hINV SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.078125 GSDMC 8 130349501 130266342 DEL SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.045454545 GSDMC 8 130349501 130307057 h2hINV SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.41509434 GSDMC 8 130349501 130641025 h2hINV SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.377272727 GSDMC 8 130349501 128653051 DUP SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 3.888888889 GSDMC 8 130349501 130308419 t2tINV SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.378698225 GSDMC 8 130349501 130645299 t2tINV SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.44047619 GSDMC 8 130349501 130710195 DUP SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.02688172 GSDMC 8 130349501 130817318 t2tINV SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.026109661 GSDMC 8 130349501 130883879 DUP SV DIPG06_TOR-pair 118 8.200659451 NA NA NA 0.033742331 GSDMC 8 130349501 130756669 DUP SV DIPG08_TOR-pair 20 8.200659451 NA NA NA 1 GSDMC 8 130349501 130540545 DUP SV DIPG08_TOR-pair 20 8.200659451 NA NA NA 1 GSDMC 8 130349501 130726794 DUP SV DIPG101_EUR-pair 17 8.200659451 NA NA NA 1.447368421 GSDMC 8 130349501 130581390 DUP SV DIPG101_EUR-pair 17 8.200659451 NA NA NA 1.447368421 GSDMC 8 130349501 130707619 DUP SV DIPG111_EUR-pair 48 8.200659451 NA NA NA 0.185185185 GSDMC 8 130349501 130502737 DUP SV DIPG111_EUR-pair 48 8.200659451 NA NA NA 0.185185185 GSDMC 8 130349501 130660277 DUP SV DIPG113_EUR-pair 3 8.200659451 NA NA NA 0.740740741 GSDMC 8 130349501 130591480 DUP SV DIPG113_EUR-pair 3 8.200659451 NA NA NA 0.740740741 GSDMC 8 130349501 130735599 DUP SV DIPG114_EUR-pair 8 8.200659451 NA NA NA 0.642857143 GSDMC 8 130349501 130618026 DUP SV DIPG114_EUR-pair 8 8.200659451 NA NA NA 0.642857143 GSDMC 8 130349501 142973359 INTER SV DIPG27_TOR-pair 65 8.200659451 NA NA NA 0.409090909 GSDMC 8 130349501 130755147 DUP SV DIPG30_TOR-pair 8 8.200659451 NA NA NA 2.235294118 GSDMC 8 130349501 130534275 DUP SV DIPG30_TOR-pair 8 8.200659451 NA NA NA 2.235294118 GSDMC 8 130349501 143136956 h2hINV SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 0.904761905 GSDMC 8 130349501 130763294 t2tINV SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 0.5 GSDMC 8 130349501 142299296 DUP SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 1.060606061 GSDMC 8 130349501 126636149 h2hINV SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 0.254901961 GSDMC 8 130349501 127753724 h2hINV SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 0.414285714 GSDMC 8 130349501 127970442 h2hINV SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 0.435897436 GSDMC 8 130349501 128426125 DEL SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 0.243243243 GSDMC 8 130349501 128912817 h2hINV SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 0.405405405 GSDMC 8 130349501 126759226 t2tINV SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 0.405405405 GSDMC 8 130349501 128720196 t2tINV SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 0.604651163 GSDMC 8 130349501 128934341 t2tINV SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 0.295774648 GSDMC 8 130349501 130658918 t2tINV SV DIPG60_TOR-pair 259 8.200659451 NA NA NA 0.5 GSDMC 8 130349501 130669026 DUP SV GBM18-pair 37 8.200659451 NA NA NA 1.954545455 GSDMC 8 130349501 130430044 DUP SV GBM18-pair 37 8.200659451 NA NA NA 1.954545455 GSDMC 8 130349501 130671039 DUP SV GBM83-pair 10 8.200659451 NA NA NA 0.333333333 GSDMC 8 130349501 130577597 DUP SV GBM83-pair 10 8.200659451 NA NA NA 0.333333333 GSDMC 8 130349501 130800237 t2tINV SV SJHGG006_A_STJ_WGS-pair 44 8.200659451 NA NA NA 0.098591549 GSDMC 8 130349501 130797781 t2tINV SV SJHGG006_A_STJ_WGS-pair 44 8.200659451 NA NA NA 0.098591549 GSDMC 8 130349501 142973365 INTER SV SJHGG017_D_STJ_WGS-pair 7 8.200659451 NA NA NA 0.875 DACH1 13 71299501 89489992 h2hINV SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.212765957 DACH1 13 71299501 89637529 DEL SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.37254902 DACH1 13 71299501 89020069 DEL SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.198895028 DACH1 13 71299501 89020136 t2tINV SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.243243243 DACH1 13 71299501 89020249 DUP SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.131147541 DACH1 13 71299501 71595125 DUP SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.005604484 DACH1 13 71299501 71595242 DUP SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.002989537 DACH1 13 71299501 89020199 DUP SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.171428571 DACH1 13 71299501 71595540 DUP SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.007526882 DACH1 13 71299501 89489620 t2tINV SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.1875 DACH1 13 71299501 71594642 DUP SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.005604484 DACH1 13 71299501 71594859 DUP SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.002989537 DACH1 13 71299501 71594886 DUP SV 00-015Primary 120 3.619788758 NA NA NA 0.007526882 DACH1 13 71299501 24530467 INTER SV 00-019Primary 1166 3.619788758 NA NA NA 0.6 DACH1 13 71299501 73489057 h2hINV SV 00-030Primary 238 3.619788758 NA NA NA 0.555555556 DACH1 13 71299501 45566401 INTER SV 00-030Primary 238 3.619788758 NA NA NA 0.838709677 DACH1 13 71299501 23349442 INTER SV DIPG105_EUR-pair 36 3.619788758 NA NA NA 2.733333333 DACH1 13 71299501 23351444 INTER SV DIPG105_EUR-pair 36 3.619788758 NA NA NA 2.785714286 DACH1 13 71299501 68042462 h2hINV SV GBM56-pair 79 3.619788758 NA NA NA 2.684210526 ZNF469 16 87799501 88048931 DEL SV 10-417-2218_pair 305 4.096910013 NA NA NA 0.066666667 ZNF469 16 87799501 88048623 DEL SV 10-417-2218_pair 305 4.096910013 NA NA NA 0.066666667 ZNF469 16 87799501 88023555 DEL SV 10-417-3085_pair 148 4.096910013 NA NA NA 0.056179775 ZNF469 16 87799501 88023194 DEL SV 10-417-3085_pair 148 4.096910013 NA NA NA 0.056179775 ZNF469 16 87799501 30501850 INTER SV 10-417-4227_pair 129 4.096910013 NA NA NA 0.254901961 ZNF469 16 87799501 88158085 DEL SV 10-417-5243_pair 122 4.096910013 NA NA NA 0.03030303 ZNF469 16 87799501 30501847 INTER SV 10-417-5243_pair 122 4.096910013 NA NA NA 0.181818182 ZNF469 16 87799501 88157696 DEL SV 10-417-5243_pair 122 4.096910013 NA NA NA 0.03030303 ZNF469 16 87799501 122899861 INTER SV GBM60-pair 1413 4.096910013 NA NA NA 1.24 ZNF469 16 87799501 106296689 INTER SV GBM60-pair 1413 4.096910013 NA NA NA 0.933333333 ZNF469 16 87799501 66327674 INTER SV GBM60-pair 1413 4.096910013 NA NA NA 1.090909091 GNAL 18 10999501 11026030 DEL SV 00-004Recurrent 422 3.853871964 NA NA NA 0.226804124 GNAL 18 10999501 18230385 INTER SV 00-004Recurrent 422 3.853871964 NA NA NA 0.3125 GNAL 18 10999501 18230891 INTER SV 00-004Recurrent 422 3.853871964 NA NA NA 0.318181818 GNAL 18 10999501 11026028 DEL SV 00-004Recurrent 422 3.853871964 NA NA NA 0.226804124 GNAL 18 10999501 11209103 DEL SV 10-417-1112_pair 58 3.853871964 NA NA NA 0.037037037 GNAL 18 10999501 11208844 DEL SV 10-417-1112_pair 58 3.853871964 NA NA NA 0.037037037 GNAL 18 10999501 100020847 INTER SV GBM11-pair 60 3.853871964 NA NA NA 0.3 GNAL 18 10999501 120348379 INTER SV GBM11-pair 60 3.853871964 NA NA NA 0.310344828 GNAL 18 10999501 138248208 INTER SV GBM11-pair 60 3.853871964 NA NA NA 0.545454545 GNAL 18 10999501 117062327 INTER SV GBM17-pair 161 3.853871964 NA NA NA 1.615384615 GNAL 18 10999501 132448265 INTER SV GBM17-pair 161 3.853871964 NA NA NA 2.117647059 GNAL 18 10999501 135644044 INTER SV GBM17-pair 161 3.853871964 NA NA NA 1.533333333 GNAL 18 10999501 11503405 DEL SV SJHGG022_D_STJ_WGS-pair 49 3.853871964 NA NA NA 0.233333333